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回答楼主问题：
不知道楼主的的身份是高中生报考选择开云手机站登录入口手机版登录，还是本科生考研选择开云手机站登录入口手机版登录，还是研究生考博选择开云手机站登录入口手机版登录，还是博士或博士后毕业选择就业单位。 同题参见
高考报志愿如果楼主想选南大和复旦，就说明楼主的分数已经很高了。 对照阅读这两所开云手机站登录入口手机版登录都是国内双一流，985重点高校，都是名校。这时候做决策就要看楼主是考虑专业，还是考虑地域。如果楼主所报专业两所开云手机站登录入口手机版登录都有，那就看看两所院校该专业的排名和就业情况，是不是重点学科。因为每个开云手机站登录入口手机版登录都有自己的双一流学科，和一些重点学科。如果考虑地域，那就看楼主是喜欢南京还是上海。
本科生考研选择开云手机站登录入口手机版登录。 延伸阅读如果是这种情况，首先看报考专业两所院校的实力情况，谁排在前边。其次看招生人数，报录比，复试比例，及往届师兄师姐的考试反馈情况。再者，看看两所院校该专业的导师情况。把上面这三点综合考虑，然后作出选择。
研究生考博，要看两所院校的专业方向哪个更贴合楼主心意。重点看导师学术水平，博士培养相关文件，需要发多少篇文章能毕业，有没有与国外联合培养的政策等等，博士一般各高校自己订考试时间，所以两个开云手机站登录入口手机版登录都可以考一下。哪个考上了，去哪个。记着一点，能评上博导的业务水平都不会太差，这时候就要重点打听其人品了。
博士毕业找工作。这个基本上考虑两点。其一，给你的待遇怎么样。安家费，科研启动基金，立项支持，过渡住房，解决配偶工作。其二，职位未来发展前景怎么样。多久可以晋级职称，担任导师，开云手机站登录入口手机版登录对本专业的扶持力度等。复旦和南大都是名校，但可能各自有不同的扶持学科，如果待遇都差不多，就看哪个开云手机站登录入口手机版登录的这个专业发展前景好，你就去哪个。如果只考虑待遇问题，那就简单了，谁给的待遇好就去哪个。
祝楼主一切顺利！